同时，因为四衙禁军和四境边军各行其事，鲜有交集，彼此之间很难达成互信。这种情况在和平时期倒是无所谓，但在战时，却是会要人命的。

想想前世，常凯申手下的中央军和地方军联合围剿红军时，出的各种洋相，显的各种眼，就知道了。

所以，成立参谋部，统管军事调度权和军事指挥权，是非常必要的。

此外，陈琦还将兵部进行了职能化改制，分为了军籍，军政和军械三科，明确了各科的具体职能。

军籍科负责武官选用及兵籍管理工作。

武官选用是指，兵部有权针对州府守备军，郡县护卫军的武官进行遴选，任用，派遣等工作。

兵籍管理是指，兵部要为全国所有常备军和退役军人建立标准档案，即兵籍。朝廷会根据兵籍安排军饷，发放军粮；同时也会按照兵籍，进行背景调查和家属安置。

等到战役之后，兵籍也是分封功勋，安置烈士的重要资料。

军政科负责军事行政的相关工作，具体职能包括军队架构的组织编制；武官的考核、升迁；军事关隘、设施的维护和翻修；军事驿站和军用驰道的新建、保养；军资财物的管理和发放等。

军政科是兵部组织架构中的中坚力量，他负责的工作虽然没有看上去那么高大上，但却是军队后勤保障的关键。

军政科的效率高低，直接影响的就是军队战斗力是否能够一直保持。军政科有作为，后勤有保障，前线将领就能放心大胆的扩大战果，不用担心后援不足。

军政科不作为，后勤没有保障，就会出现，‘前方吃紧，后方紧吃’的局面。战败，似乎也就不可避免了。

军械科负责全国所有地区武器装备的储藏，管理和供给等相关工作。

其中，军械科最为关键的任务，就是武器的管理工作。包括武器的订制，采购，核查，销毁。

兵部职能改制，客观上剥离了兵部对兵权的掌握，将兵部的职能固定在了辅助参谋部掌管全国军队的方面。

尤其是兵部三科的职能确认，直接将兵部的组织架构都给明确了，陈伽罗和吏部尚书可以按照组织架构和职能分配，直接安排合适的人上任就可以了。

除了兵部改制外，陈琦还提出了四衙禁军要‘精兵简政’的意见。随着陈伽罗的儿子们渐渐成年，开始尝试接掌四境军务。四衙禁军职能中，防范藩王祸乱的职能客观上是被弱化了。

趁着这个时机，四衙禁军可以考虑在内部